Alutaguse on kuulus oma põlislaante poolest, mis moodustavad koos soode ja rabadega Eesti olulisema loodusmaastike kompleksi. Siin elutseb hinnanguliselt 10 000 metsaliiki, sealhulgas tõelisi haruldusi nagu habekakk ja lendorav ning teisigi kaitset vajavaid liike nagu metsis ja teder. Siinsed alad on kallid ja olulised kohalikele inimestele, samuti matkalistele ja marjulistele. Paraku ei ole paljud Alutaguse metsaalad kaitstud ning neid ohustab lagedaks raiumine.